Да просто надо посмотреть на NEI и сделать так же. Там буквально уже всё придумали про то, как комплексные крафты удобно показывать. И дерево крафта есть, и у каждого предмета можно посмотреть применения, а не только как он крафтится. Просто посмотреть, как сделан NEI и реализовать полезные оттуда фичи в СК